| 第五管区海上保安本部 | |||||||
| 総務部 | 総務課 | 人事課 | 厚生課 | 情報通信課 | |||
| 経理補給部 | 経理課 | 補給課 | |||||
| 船舶技術部 | 管理課 | 技術課 | 機器課 | ||||
| 警備救難部 | 警備課 | 刑事課 | 警備情報課 | 国際刑事課 | 救難課 | 環境防災課 | |
| 海洋情報部 | 監理課 | 海洋調査課 | 測量船 うずしお |
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| 交通部 | 企画課 | 航行安全課 | 安全対策課 | 整備課 | |||
| 管内事務所等 | |||||||||||||
| 大阪海上保安監部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 航行安全課 | 港内管制室 | 巡視船 かつらぎ |
巡視艇 よどぎく |
巡視艇 みおかぜ |
巡視艇 こまかぜ |
巡視艇 てるぎく |
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| 神戸海上保安部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 航行安全課 | 巡視船せっつ | 巡視艇 はるなみ |
巡視艇 ふどう |
巡視艇 あわぎり |
巡視艇 まやざくら |
巡視艇 きくかぜ |
巡視艇 しらぎく |
巡視艇 なだかぜ |
灯台見回り船 こううん |
| 姫路海上保安部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 巡視艇 ぬのびき |
巡視艇 ひめざくら |
巡視艇 ひめぎく |
巡視艇 さぎかぜ |
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| 和歌山海上保安部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 巡視船 きい |
巡視艇 きいかぜ |
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| 田辺海上保安部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 巡視船 みなべ |
巡視船 こうや |
巡視艇 むろかぜ |
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| 徳島海上保安部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 巡視船 びざん |
巡視艇 うずかぜ |
美波分室 | 巡視艇 あしび |
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| 高知海上保安部 | 管理課 | 警備救難課 | 交通課 | 巡視船 とさ |
巡視船 さんれい |
巡視艇 とさみずき |
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| 関西空港海上 保安航空基地 |
管理課 | 警備救難課 | 飛行科 | 整備科 | 通信科 | 巡視艇 きしかぜ |
巡視艇 そらかぜ |
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| 大阪湾海上交通 センター |
整備課 | 情報課 | 運用管制課 | ||||||||||
| 堺海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 みのお |
巡視艇 しぎかぜ |
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| 岸和田海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 あやめ |
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| 西宮海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 しずかぜ |
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| 加古川海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 まやかぜ |
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| 海南海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 わかづき |
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| 串本海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 むろづき |
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| 宿毛海上保安署 | 保安署 | 巡視船 あらせ |
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| 土佐清水海上保安署 | 保安署 | 巡視艇 とさつばき |
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| 下里水路観測所 | 観測所 | ||||||||||||
