上越海上保安署は上越市・柏崎市・糸魚川市など新潟県南部の地域を担当しています。
　直江津港（上越市）には、多くの貨物船が入港するほか、日本海拠点港（液化天然ガス部門）に指定されているなど、重要な港となっています。
上越海上保安署は平成１７年４月１日、直江津海上保安署から名称変更されました。