| 昭和２６年７月 | 東京海上保安部那珂湊分室として発足 |
| 昭和２８年１０月 | 全国的組織整備に伴い銚子海上保安部那珂湊分室となる |
| 昭和２９年５月 | 那珂湊市海門町に木造新庁舎完成し移転 |
| 昭和３０年３月 | 銚子海上保安部那珂湊警備救難署に昇格 |
| 昭和３０年８月 | 銚子海上保安部那珂湊海上保安署に改称 |
| 昭和３７年４月 | 那珂湊海上保安部に昇格 |
| 昭和４５年４月 | 鹿島海上保安署が設置 |
| 昭和４８年５月 | 鹿島海上保安署、鹿島港湾合同庁舎に移転 |
| 平成２年２月 | 那珂湊市和田町に那珂湊運輸総合庁舎が完成し移転 |
| 平成５年４月 | 那珂湊海上保安部に警備救難課が設置 |
| 平成５年１０月 | 日立分室設置 |
| 平成１６年４月 | 茨城海上保安部に改称 |
| 航行援助センター発足 | |
| 平成１９年４月 | 航行援助センターに航行安全業務を追加し、交通課が発足 |